Resultados obtenidos hasta el momento y la experiencia de participar en ABRCMS

Este semestre fue uno de arduo trabajo, pero al final vimos los frutos de tanto esfuerzo. En cuanto a los resultados obtenidos, estos se van a dividir en dependientes e independientes de cultivo. Para la parte dependiente de cultivo, se realizó un conteo total de las colonias encontradas en las Salinas y en Boquerón, utilizando medio Seghal Gibbons al 10% y 15% de NaCl. En el caso de las Salinas, se encontró un número mayor de colonias a 10% de NaCl, lo cual pudo haberse debido a que la salinidad es un factor determinante para el crecimiento de las bacterias. Por otra parte, para el conteo realizado en el Bosque de Boquerón, se encontró un menor número de colonias que en las Salinas. Además, había menos colonias a 10% que a 15% de NaCl. También tuvimos la oportunidad de tomarle fotos a varias de las colonias, utilizando el Microscopio Electrónico de Rastreo. En estas fotos pudimos confirmar que nuestros microorganismos son bacilos; lo que sí capto nuestra atención, es que pudimos observar la diferencia entre los bacilos a 10% y a 15% de NaCl. A 15% estos bacilos se ven más alargados y más finitos; mientras que a 10% NaCl, los bacilos se observan más cortos y más anchos.

En cuanto a la parte independiente de cultivo, se realizaron varios PCR de Boquerón y Salinas. Para las muestras de Boquerón, se realizó un PCR de extracción total de DNA de las plantas D y K, a 0cm y 20cm; en este se observaron bandas en todas las plantas, pero en la planta K a 20cm no hubo amplificación. En cuanto a Salinas, se hizo un PCR de DNA total metagenómico de las plantas 13, 14, 15, 16, 17 y 18 a 0cm; donde se observaron bandas que indicaban la presencia de microorganismos, excepto en la planta 18, donde no se observó amplificación. En el PCR del 16S rDNA para las muestras 8 y 16 a 0cm de profundidad, se observó amplificación de la planta 16. Algunos de estos PCR están por repetirse, para determinar el porqué de las muestras que no amplificaron. Por último, se realizó un PCR de Arqueas a 0cm de profundidad, combinando muestras de Salinas y Boquerón; de este pudimos determinar que hasta el momento se ha encontrado la presencia de Arqueas en algunas muestras en Boquerón.

De acuerdo a los resultados obtenidos hasta este momento, puede concluirse que sí hay presencia de microorganismos halofílicos/halotolerantes en las Salinas de Cabo Rojo y en el Bosque Nacional de Boquerón (los cuales son los dos lugares de muestreo en la investigación), asociados al suelo del mangle negro. Además, la diversidad microbiana de estos microorganismos halofílicos/halotolerantes, varía dependiendo del lugar, la composición del suelo, y la salinidad a la que se cultivaron estas muestras, tanto 10% como 15% de NaCl.

En cuanto a las metas futuras para el próximo semestre podemos destacar varias cosas tanto para la parte dependiente de cultivo, como para la parte independiente de cultivo. Como dependiente de cultivo, se realizará Box PCR y luego secuenciación de DNA; por otra parte, para la parte independiente de cultivo se pretende continuar con el TRFLP, realizar biblioteca de genes, y secuenciación de DNA.

Experiencia en ABRCMS

Del 5 – 9 de noviembre de 2008, tuve la oportunidad de asistir y presentar mi poster de investigación en la Conferencia ABRCMS (Annual Biomedical Research Conference for Minority Students), celebrada en Orlando, Florida. Esta fue una gran experiencia, debido a que era la primera vez que estaba presentando un poster. En cuanto a la conferencia, puedo decir que fue una gran oportunidad, además de que tuve la oportunidad de escuhar a grandes profesionales de la ciencia hablando acerca de diversos tópicos. Dos conferencias que me llamaron mucho la atención, fueron la del Dr. David Page, titulada “Choosing Sex:  How Germ Cells Take the Road Less Traveled”; y la de la Dra. Bonnie Bassler, “How Bacteria Talk to Each Other.” Por otra parte, participamos de conferencias relacionadas a cómo aplicar para escuela graduada, cómo sobrevivir los primeros 18 meses de doctorado (la cual fue muy interesante y realista), entre otras. En adición, ABRCMS fue mi oportunidad para tomar mi decisión final acerca de las escuelas graduadas a las que voy a solicitar para realizar mi PhD en Microbiología Clínica. Me ayudó a conocer un poco más acerca de diferentes escuelas, a conocer personas de contacto en esas escuelas, así como también de conocer nuevas escuelas y nuevos programas los cuales no conocía y que me interesaron. Agradezco al programa BioMinds por la oportunidad brindada, y por permitir realizar este viaje de enriquecimiento profesional.

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