Nuevo semestre, nuevas metas y un mismo trabajo…

Para este semestre se busca continuar con el trabajo del semestre anterior; ya que continuaremos purificando y haciendo extracción de DNA de los microorganismos halofílicos/halotolerantes obtenidos en los muestreos anteriores. En adición, para el método dependiente de cultivo se va a realizar Box PCR y Secuenciación de DNA. Con la técnica del Box PCR se pretende la amplificación de todo el genoma del organismo, no solo de la región 16S como se ha estado haciendo anteriormente con el PCR. En la parte independiente de cultivo, vamos a continuar haciendo TRFLP con el propósito de determinar la diversidad del suelo; así como también vamos a realizar bibliotecas de genes para obtener las secuencias de posibles microorganismos que puedan habitar en esos ambientes pero que no son cultivables. El propósito de realizar estas técnicas, es poder identificar y caracterizar los microorganismos halofílicos/halotolerantes que se encuentran presentes en la rizosfera del mangle en Boquerón y las Salinas en Cabo Rojo.

Para finales de este semestre, se espera haber logrado obtener resultados positivos en el Box PCR, poder aislar los clones una vez realizada la biblioteca de genes, para entonces enviarlos a secuenciar. Además, este mes se va a realizar otro muestreo tanto en el bosque de Boquerón, como en las Salinas en Cabo Rojo; una vez realizado este muestreo hay que realizar todo el proceso que hemos hecho hasta el momento, pero ahora con nuevas muestras de suelo.

El objetivo más importante para mí, es poder tener éxito en la identificación y caracterización de los microorganismos que se han aislado hasta el momento en nuestros lugares de muestreo, y poder así conocer que organismos son los allí habitan, y conocer un poco más acerca de ellos y de su función. Esto, debido a que una de las metas de este proyecto es que los resultados que de aquí se obtengan sirvan para proveer información acerca de la fisiología y química de las poblaciones microbianas que interactúan con el mangle y que proveen nuevos organismos con algún potencial biotecnológico.

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